Quỹ bảo tồn Mekong (MCF) đã được thành lập để đương đầu với các mối đe dọa và thúc đẩy phát triển bền vững vùng đồng bằng sông Cửu Long. Nó được đăng ký như một Quỹ xã hội ở Việt Nam, và dựa trên một thế mạnh về xây dựng mạng lưới, tính minh bạch và hoạch định chính sách dựa trên bằng chứng khoa học.

MCF sẽ phân bổ kinh phí cho các dự án nghiên cứu bảo tồn hệ sinh thái, đa dạng sinh học trong khu vực Mekong thông qua việc huy động vốn và hợp tác với nhiều nhà tài trợ khác nhau.